Jan Twardowski sinh ngày 1 tháng 6 năm 1915 tại Warsaw, Vương quốc Lập hiến Ba Lan. Cha mẹ ông là Jan Twardowski và Aniela Maria Konderska. Vài tuần sau khi sinh, do những biến cố của Chiến tranh thế giới thứ nhất, gia đình ông chuyển đến Nga. 3 năm sau, họ trở lại Warsaw. Ông học xong trung học vào năm 1935.

Năm 1932, ông bắt đầu làm việc cho tờ báo thanh niên "Kuźnia Młodych" ("Forge of the Young"). Ông có một chuyên mục riêng để đăng thơ, truyện ngắn và các bài phỏng vấn nhiều nhà văn khác nhau.

Sau khi tốt nghiệp trung học, Jan Twardowski bắt đầu theo học ngành văn học tại Đại học Józef Piłsudski. Năm 1937, ông xuất bản tập thơ đầu tiên của mình.

Trong Chiến tranh thế giới thứ hai, ông tham gia nhiều hoạt động khác nhau do lực lượng Armia Krajowa tổ chức và chiến đấu trong cuộc Khởi nghĩa Warsaw.

Sau chiến tranh, Jan Twardowski gia nhập chủng viện và bắt đầu theo học chuyên ngành thần học tại Đại học Warsaw. Ông trở thành linh mục vào năm 1948. Năm 1959, ông trở thành cha hạt trưởng của Nhà thờ Thăm viếng. Các bài viết của ông được đăng trên một tạp chí Công giáo nổi tiếng của Ba Lan có tên Tygodnik Powszechny. Ông nổi tiếng vào năm 1960 sau khi xuất bản tập thơ đầu tiên của mình là "Znak Ufności" ("The Sign of Trust"). Năm 1980, ông được nhận các giải thưởng International PEN và Robert Graves cho thành tựu trọn đời và được nhận Huân chương Uśmiechu vào năm 1996. Năm 2000, Twardowski giành giải IKAR và được trao giải TOTUS một năm sau đó.

Jan Twardowski mất ngày 18 tháng 1 năm 2006 tại Warsaw.